淘宝子账号和主账号之间的聊天消息不同步主要有以下几个原因：

1. 聊天记录分配机制

淘宝的聊天系统通常是将买家的消息分配给一个特定的子账号进行接待，而不是所有子账号同时接收。因此，如果一个买家与某个子账号进行聊天，其他子账号（包括主账号）可能无法实时看到这些聊天记录。

2. 权限设置

子账号默认情况下可能没有权限查看其他子账号与买家的聊天记录。为了实现聊天记录的同步，需要在子账号管理中设置共享聊天记录的权限。只有经过授权的子账号才能查看其他子账号的聊天记录。

3. 分流设置

在旺旺或者千牛等客服工具中，如果没有正确设置消息分流，可能会导致某些子账号收不到买家的消息。主账号需要在分流设置中将其纳入接待范围，才能接收到相应的聊天信息。

4. 技术限制

从技术层面来说，为了保证系统的稳定性和效率，聊天消息的同步可能会有一定的延迟或者限制，特别是当涉及到大量聊天记录时。

5. 工作流程设计

商家可能有意设计成子账号之间聊天消息不同步，以确保每个子账号负责其自己的客户沟通，避免信息混乱和重复响应。

要实现主账号和子账号之间的聊天消息同步，商家需要在子账号管理和客服工具的设置中进行相应的配置，包括开启聊天记录共享权限、合理设置消息分流以及确保技术层面的支持。这样，主账号就能查看到子账号与买家的聊天记录，以便于监控服务质量、协调工作或处理疑难问题。